Indholdsfortegnelse:
- Genetisk screeningstjenester
- DNA-samling
- DNA-rapporter og ekstra funktioner
- Resultaterne
- Sundhed og mere
- Genetiske konklusioner
Video: Tagging and DNA testing calves (November 2024)
Grundlagt af videnskabsbrødre efter mange års studier af hundegenetik, har Embark ($ 199) den største database over hundeacer af sin art. Den kontrollerer mod mere end 250 typer hvalpe såvel som ulve, coyoter, dingoer og de såkaldte fritgående "landsbyhunde". Denne bredde af analysen er nøglen, når det gælder nøjagtigheden af racebestemmelse. Kæmpestart kontrollerer også dit kæledyrs DNA for tegn på 165 genetiske medicinske tilstande, og kan afgøre, om din pupper er en bærer af eller i fare for at få en fuldblæst sygdom. Det er mere mutationstest end nogen anden DNA-testkit. Embark er dyrt og tilbyder måske for meget information, men det er dets eneste fejl.
Genetisk screeningstjenester
Embark er det dyreste DNA-sæt til kæledyr, jeg testede, og det tilbydes kun i et enkelt-test-sæt. På dette tidspunkt kan du få en bedre pris, hvis du tester flere hunde (brug kuponkode "MULTIPACK" på Embarks websted), med et maksimum på 20 procent rabat på fire eller flere sæt. Krisesentre, opdrættere og dyrlæger kan også få rabatter. Men som man siger, får du det, du betaler for. Erklæringen på Embarks websted hævder, at dens raceidentifikationsproces "tester over 200.000 genetiske markører og bygger din hunds racemix kromosom efter kromosom."
Under tilmeldingsprocessen, som du skal udføre, før du sender prøven, beder Embark dig om tilladelse til at bruge din prøve til forskning. Embark er indgået et samarbejde med Cornell University College of Veterinary Medicine - det hjælper medstifter Adam Boyko er professor der - og derfor er forskere interesseret i Embarks data. Virksomheden vil også samarbejde med eksterne forskere, der bruger DNA-testinfo, såsom nuværende partnere VetGenomics og Doberman Diversity Project.
DNA-samling
Embarks emballage skiller sig ud mod konkurrencen. For eksempel kan jeg lide kittets klare og kortfattede illustrerede instruktioner. Et kort inde viser alle instruktionerne, plus det viser de URL-adresser, du kan besøge for at aktivere kittet, se på racerlister, lære hvordan man kan svømme en hundes kind for at få en prøve og mere.
Der er også et "missil-grade" stålhundtag i pakken, som har en URL på bagsiden. Hvis din hund går tabt, kan hvem, der finder den, bruge URL-adressen til at få adgang til delte data om hunden. Hvis denne person ringer til telefonnummeret på mærket, vil Embark fungere som en tredjepart for at parre finderen og ejeren. Med andre ord udleverer Embark ikke bare dine personlige kontaktoplysninger.
Den første ting, du gør, er naturligvis at aktivere kittet - ligesom med humane DNA-sæt. Du har muligheden for at bruge Facebook- eller Google-tilmeldinger eller oprette en konto med din e-mail-adresse. Hvis du har flere sæt til flere hunde, skal du registrere alle sætene på den samme konto for nem online adgang. Når din konto er live, skal du oprette en hundeprofil for hvert sæt, du vil aktivere, og registrere hvert med numrene fra et Embark-kit.
Her kan du også beslutte, om du vil have din hunds data til at bidrage til medicinsk og videnskabelig forskning (mere om det nedenfor). Embark informerer dig også om, at den vil sende opdateringer via e-mail, og hvis du ønsker det og er i USA, SMS-tekst besked.
Advarslerne oven på pakken instruerer dig om ikke at knuse kassen, da den fungerer som returforsendelsesbeholder til DNA-prøven. Dette er den eneste hund-DNA-test, jeg har set, der kræver en enkelt pinde - resten kræver to prøver. Embarks opsamlingssvamp kommer på enden af en plastbeholder fyldt med en stabiliserende væske. Dæk lommen på en hunds nederste kindpose (mellem tandkød og kind, helst uden at de tygger den) i 30 sekunder - det er 10 sekunder længere end konkurrencen. Skru enheden ud, vend den om, og anbring svampen i væsken. Ryst det forsigtigt i 10 sekunder, og prøven er klar til at blive sendt i posten. Embark bruger tilsyneladende en sampler fra et firma kaldet DNAGenotek; nedenfor er videoen af instruktioner, der bruges på Embarks websted:
DNA-swab-testene fra konkurrencen involverer simpelthen at smide nogle lange bomuldspinde i en konvolut. Embarks test føles mere højteknologisk og pålidelig, selvom der ikke er nogen måde at være sikker på. Dette er den samme metode, der anvendes af den humane DNA-tester MyHeritage DNA. Når alt kommer til alt kan du ikke rigtig få hunde til at spytte i et rør, som mennesker gør med 23andMe.
Følg instruktionerne for at lægge prøven i den medfølgende plastkonvolut, klap det hele i den samme kasse, det kom i, og luk klappen. Pop det i posten. Mine gik til Embarks laboratorium i hovedkvarteret i Boston. Alt porto er forudbetalt.
Estimatet for at få svaret fra Embark er to til fire uger. Jeg modtog svar på et sæt på 19 dage; den anden prøve dukkede op med raceresultater på 21 dage (med en ekstra dag, hvor resten af info skulle vises). Dette er en fremragende omdrejningstid.
DNA-rapporter og ekstra funktioner
Embark holder en eksemplarapport online med CEO's "latterligt fotogene" hund, Harley. (Hunden er faktisk fotogen.) Når din prøve er sendt, holder Embark dig informeret via e-mail under hele processen. Jeg fik en e-mail om, at kittet var på vej mindre end tre timer, efter at jeg faldt det på postkontoret. Jeg fik besked om prøvenes ankomst til laboratoriet, starten på genotype, da genomikere (videnskabsmand, der er specialiseret i genomer), ville undersøge prøven, og til sidst en e-mail, der siger, at resultaterne var i. Jeg fik også en til den crappy film Alpha fordi Embark har en aftale med det. Sundhedsresultater tager undertiden længere tid at vise sig end raceresultater.
I modsætning til de andre DNA-tests, vi har udført, lægger Embark mange af resultaterne i den endelige e-mail, inklusive et lille donutdiagram med oprindelige raceresultater, og endda et lille tip af, hvor meget ulv-DNA der er i din rent dominerede doggy. For de fulde resultater logger du ind via My Embark-siden. Der kan du også udskrive PDF-rapporter, skønt ikke alle data online vises i PDF.
Min metode var at teste en renavlet hund (Griffin) en gang og se, om testfirmaet ville få racen rigtigt, derefter teste min følgesvend af blandet race (Madison) to gange - en gang under et falskt navn ("Daisy") og en ny konto - for at se, om resultaterne var de samme begge gange. I betragtning af, at testene blev leveret af Embark til vores anvendelser, er det muligt, at det bare kunne spore de prøvenumre, den sendte til PCMag, og holde øje med sådant trickery, men det virker som en masse arbejde.
Resultaterne
Det første stop, du sandsynligvis ønsker at foretage i de fulde resultater, er avls-knappen. Jeg er glad for at kunne rapportere, at Embark troede Griffin var en Golden Retriever på 100, 0 procent, hvilket er enig med et par andre DNA-test, plus Griffins ejer og opdrætter.
Madison kom selvfølgelig tilbage med en alt-over-the-sted blanding af racer: 34, 2 procent amerikansk Pit Bull Terrier, 17, 5 procent Shetland Sheepdog, 13 procent Labrador, 12, 4 procent engelsk Springer Spaniel, 9, 1 procent Bull Terrier, 7, 1 procent tysk Shephard Dog (GSD) og 6, 7 procent Rottweiler. Ingen anden DNA-test bundede hende til at have Springer eller GSD i hendes gener.
Hvad skete der med den anden test af Madison (alias "Daisy")? Alle de samme racer var der, bare lidt forskellige procenter på dem i midten.
Det er interessant, at Embarks top race for Madison er Pit Bull Terrier og ikke American Staffordshire Terrier - begge bliver typisk klumpet sammen under "pit bull" moniker, men der er forskel, i det mindste i størrelse og udseende. Amerikanske Staffordshire Terrier var et topvalg for Madison ved andre DNA-test, som Wisdom Panel.
Aflsafsnittet giver også nogle oplysninger om racerfamilierne i hundens makeup, plus giver et kig på haplotypen (DNA-sekvens) for hundens mor og far, endda viser kort over hvor hundens gamle forfædre måske har sin oprindelse. Dette er trivielle ting, og noget af det (som kortene) føles som fyldstof.
Slægtstræerne til Madison og "Daisy" var identiske. Tests fra DNA-affirm og DNA My Dog kunne ikke være ens med dem selv, hvilket kastede enhver tro på dem i tvivl. Ikke så med Embark. Familieoversigten bryder racen af forældrene. Bemærk, at Griffin ikke engang tjente et træ, hvilket er fint, da det ville være alle Goldens.
Sundhed og mere
At gennemgå racedelen under din hunds indrejse er bare begyndelsen. Forskningsafsnittet kræver arbejde fra dig, hundeejeren - det er for dem, der planlægger at bidrage med deres hund-DNA til videnskaben. Embark håber, at du vil udfylde et par små undersøgelser for at gøre det bidrag værd, om emner som din hunds tandhelse, adfærdsproblemer og allergier og en komplet medicinsk undersøgelse. Det er nøjagtigt så sjovt, som du kunne forvente: ingen. Dog gør det, hvis du vil tjene den fulde oplevelse af at gøre verden bedre via din hunds genom.
Afsnittet om sundhed er uden tvivl det vigtigste, da det har resultaterne for alle test udført for genetiske mutationer, som din hund kunne have eller i det mindste udføre. Griffins resultater var helt klart, hvilket stemte overens med resultaterne fra Wisdom Panel. Madisons resultater var også enige - hun er en bærer for Degenerative Myelopathy, men vil ikke videregive den, da hun er spayed. Selvom det er klart, viser dette afsnit almindelige forhold for hundens race (r). De fleste af disse oplysninger vil kun være af interesse for mennesker, der har en hund i fare, men muligheden er der for at læse om alle 165.
Bemærk, at Madisons rapport kun viser resultater for 162 samlede prøver, ikke de 165, der er annonceret. Virksomhedsrepræsentanten sagde, "hvis vores algoritmer ikke er 100 procent sikre på et sundhedsopkald, vil det ikke kalde det." Hvis der er en specifik test, som en kunde ønsker resultater af, og de ikke ser det, skal du ikke antage, at det er negativt. Embark gennemgår et resultat manuelt på hundeejers anmodning.
Der er links i sektionen Sundhed til at oprette en rapport, der er let at dele eller udskrive til veterinærer. Hvis hunden er en renraset, er der også et link til at sende en rapport om de genetiske fund til Orthopaedic Foundation for Animals (OFA), en organisation, der ønsker at reducere genetisk sygdom hos ledsagende dyr.
Endelig er der et avanceret afsnit, der viser resultater, som kun en genetiker ville forstå. Det nedbryder information som mængden af race-DNA, der findes på hver af de 38 kromosomer, alt sammen i et farverigt sæt grafer. Rul ned for at få oplysninger om hundens genetiske mangfoldighed, som giver et reelt mål for indavlen (hvor tæt beslægtet hundens forældre er). Jo mere indavl, jo mere genetisk arvelige forhold kan ske. Madison the mutt's forældre havde en inavlskoefficient på 0 procent; men den renrasede Griffins forældre havde 23 procent af en del af generne, der var identiske i begge forældre.
Hvis du er et sus med at læse genomer, giver Embark dig mulighed for at downloade ZIP-filer med cirka 7 megabyte ufortolket data for de 200.000 markører i prøverne. Hvad du ville gøre med det er nogens gæt.
Karakterrapporten er noget interessant og viser de genetiske loki, der påvirker farver og frakker. Det er igen belastet med snak om kromosomer og links til andre ombordgående hunde, der har lignende fund. Undtagelsen er sektionen Innavls-koefficient, der viser, hvor meget en mor og far med en rasen hund deler de samme gener. Griffins forældre havde et resultat på 23 procent (Madison the mutt's folk: 0 procent). Det var interessant at se "Daisy" også have samme genotype som Madison. Men i det lange løb er Wisdom Panels sektion med nedtrapede egenskaber bedre for den gennemsnitlige bruger end Embarks mere komplicerede data.
Genetiske konklusioner
Embark er den rigtige deal. Hvis du hovedsageligt er bekymret for din hunds potentielle genetiske sundhedsmæssige problemer, bør dette sæt være dit første valg; det tester blot for flere problemer. For det alene er det værd at de ekstra $ 50 over prisen på Wisdom Panel. I vores resultater er racebestemmelsen for det meste konsistent. Med den videnskabelige baggrund, som virksomheden har, er der lidt grund til at føle sig mindre end selvsikker i sit resultat. Når det er sagt, er mange af de fremlagte data unødvendige og komplicerede for den gennemsnitlige hundeejer.